На территории страны расположены три крупнейших аэропорта: международный аэропорт имени Йомо Кеньятта в Найроби, международный аэропорт Мои в Момбасе и Элдорете. Их обслуживают крупнейшие кенийские авиакомпании, в том числе Kenya Airways, осуществляющие международные перелеты в страны Европы, Азии, а также в Америку и соседние африканские государства. Въезд в страну также возможен через границы Танзании, Уганды и Эфиопии, для этого необходимо заполнить соответствующие иммиграционные бланки.